玉米缺苗；种子发芽率达不到国家标准，导致出苗不齐。应加强市场监管，严禁劣质种流入市场。
种子生活力不高，虽然种子发芽率达不到国家标准，但发芽势低，肉苗出土能力差，出土过程中，营养耗尽，常受到病菌侵染，幼芽腐烂变质，不出苗。播种前不仅要进行牙率试验，确定合理播种量。
种子回芽不出土，播种后种子吸水萌发，但种子根和胚芽伸长之后，水分得不到供应，导致种子生命力停止，种子腐烂，但芽根可见，俗称回芽。要求足墒播种，墒情不足时播后浇蒙头水。
种子特性不同而造成田间和室内结果反差大。粉质型种子，粒较大，在室内做芽势。牙率试验，效果很好，但由于顶土能力差，受外界温度,湿度影响大，导致在田间生产条件下达不到出苗标准，造成缺苗。应先做好大田成苗试验，方可适量播种。

播种太深，种子不能正常出苗。播种时足墒播种，深度控制在3-4公分。

田间持水量大，低洼处积水，种子无氧呼吸时间长，产生酒精中毒，种子腐烂，不能出苗。要注意及时排水，加强中耕，增加土壤透气性。
病虫危害。金针虫、粘虫、地老虎、二点委夜蛾等虫害发生重，导致不出苗，或茎叶啃食，造成缺苗断垄。做好病虫预测预报，及时开展防治。

玉米畸形、变色；
玉米心叶扭曲。如果幼苗心叶卷曲，叶片中段有虫口，且皱缩，一般为蓟马危害所致，注意肥水管理可恢复生长。如果幼苗心叶卷曲，有大片白斑，有可能是除草剂使用不当，严重时植株钝化，下部变粗，颜色发深，有的呈现紫色，可喷施920或叶面肥进行解救，并加强肥水管理，严重的地块在不误农时的情况下进行毁种、复种。
玉米叶片边缘发红玉米苗生长正常，但叶片边缘有发红现象，严重的茎秆也有变色，是缺磷所致，一是土壤中有效磷含量低，磷供应不足，二是苗期低温影响，幼苗根系不良，吸磷能力降低，尤其是播种旱，土壤粘重、板结地块，若遇干旱，这种情况会更加严重，三是大水漫灌，有效磷随水溶解下沉，使幼苗吸收不到充足的磷。可喷施磷酸二氢钾进行缓解，苗期施肥要用复合肥，不能偏施氮肥。